El Toledo no destaca en habitabilidad, comparado con otros modelos de tamaño similar. El interior es más estrecho y limita su amplitud para cinco adultos. En las plazas traseras se acomodan dos personas de talla alta algo justos de espacio; es uno de los modelos de su categoría que menos sitio ofrece para las piernas y tiene menor altura libre al techo. Hay espacio suficiente, pero otros modelos de similar tamaño son más amplios.

El pasajero central es el que tiene menos posibilidades de encontrarse cómodo. Esto se debe a dos aspectos: que el diseño de la banqueta y el respaldo trasero está mejor acondicionado para el confort de dos ocupantes y que el prominente abultamiento que hay en el suelo limita el espacio para los pies del pasajero central. La banqueta del asiento trasero es un poco corta. El Toledo 1.9 TDI 150 CV Signa tiene tres reposacabezas detrás, pero el cinturón de seguridad no es de tres puntos en la plaza del medio.

El Toledo TDI 150 CV con el acabado Signa lleva de serie dos asientos para niños que se colocan muy fácilmente al estar integrados en la banqueta. Detrás hay también un lector de mapas doble y una práctica cortinilla enrrollable para la luna.

Tiene el maletero más grande de su categoría, junto con el Opel Vectra (ambos de 500 litros). Sólo es criticable que la boca de llenado es algo pequeña y limita el acceso; el anterior Toledo de cinco puertas se cargaba mejor. Bajo el piso hay una rueda de repuesto de buen tamaño, herramientas, gato, triángulos de emergencia, botiquín y lámparas de recambio. En el maletero también hay una toma de corriente adicional (12 voltios). La posibilidad de abatir el asiento trasero por partes (60/40) amplía las posibilidades de carga del SEAT Toledo.

El puesto de conducción sería muy cómodo si no fuera porque los asientos son muy blandos y acaba uno recolocando el cuerpo permanentemente con la sensación de que se "hunde" en el asiento. El volante, forrado en cuero, es regulable en altura y distancia y tiene un corte deportivo muy agradable de empuñar. También se puede ajustar en altura el asiento y el cinturón de seguridad. Todos los mandos se accionan fácilmente y hay numerosas guanteras que resultan muy prácticas en el uso cotidiano. La instrumentación es sencilla, se lee bien y está completada con un ordenador de viaje que indica el consumo medio, consumo instantáneo, velocidad media, autonomía, tiempo de recorrido y temperatura exterior. También hay una pantalla adicional que indica las funciones de la radio.

Los faros de doble parábola dan una buena iluminación, aunque su amplitud de campo es mejorable. No ayudan en este punto los faros antiniebla, que ofrecen una iluminación muy pobre.