El volumen de carga del modelo familiar puede aumentar hasta 1.225 litros abatiendo los asientos traseros. Dichos asientos son abatibles por partes asimétricas (60/40) y permiten adaptar las condiciones de carga a nuestras necesidades, dejando una amplia superficie de carga con fondo plano cuando están completamente abatidos. En el maletero encontramos una práctica toma de corriente adicional de 12 v (en los modelos Comfort y Elegance) y unos enganches que permiten extender una red para sujetar los objetos que transportamos en el maletero. Justo detrás de los asientos traseros hay un útil compartimento para alojar objetos largos como un paraguas y una red que se extiende hasta el techo para aislar el maletero de la zona de pasajeros.
La habitabilidad del Fabia Combi está condicionada por la escasa anchura de este coche, que ha crecido en longitud (26 cm) pero mantiene el mismo alto y ancho en su carrocería. El espacio para las piernas y la altura libre al techo son destacables en el Combi, pero la anchura es más limitada e impide acomodar a tres adultos con amplitud. No es más estrecho que otros modelos similares, pero tampoco ofrece una anchura interior en la parte trasera al nivel de modelos como el Ford Focus Familiar (136 cm) o el Renault Mégane Break (136 cm). Sí está al mismo nivel que estos modelos de un segmento superior en espacio para las piernas y altura libre al techo.
ESPACIO INTERIOR DEL Škoda FABIA COMBI
| ANCHURA | Medida a la altura de los hombros |
| Plazas delanteras (cm) | 134 |
| Plazas traseras (cm) | 133 |
| ALTURA | Medida desde la base de la banqueta hasta el techo |
| Plazas delanteras (cm) | 94 |
| Plazas traseras (cm) | 91 |
| ESPACIO PARA PIERNAS | En la plazas delanteras, mínimo y máximo medido desde el pedal de freno al respaldo. En las traseras, medido con un espacio en las plazas delanteras de 100 cm |
| Plazas delanteras (cm) | 81/105 |
| Plazas traseras (cm) | 68 |